1960年盧嘉錫院士創建研究所


1962年更名爲華東物質結構研究所


1973年定名爲中國科學院福建物質結構研究所


2001年進入中科院知識創新工程。


2008年評估進入中科院優秀研究所行列。


2015年設立中國科學院海西研究院